
Photo by Unsplash
AVIDa-hTNFa
AVIDa-hTNFa は、ヒトTNFaタンパク質を免疫した2 頭のアルパカから作製した抗原抗体相互作用データセットです。このデータセットには、VHH配列が野生型TNFaタンパク質と結合するかしないかを示すラベルが含まれています。
列の説明
データセットの各列の内容の説明です。
AVIDa-hTNFa.csv
Column | Description |
VHH_sequence | VHHのアミノ酸配列 |
Ag_label | 抗原の種類 |
label | 1は結合ペアを表し、0は非結合ペアを表すバイナリラベル |
subject_species | VHHが採取された対象の種 |
subject_name | VHHが採取された対象の名前 |
subject_sex | VHHが採取された対象の性別 |
antigen_sequences.csv
Column | Description |
Ag_label | 抗原の種類 |
Ag_sequence | 抗原のアミノ酸配列 |
corpus-hTNFa.csv
Column | Description |
VHH_sequence | VHHのアミノ酸配列 |
subject_species | VHHが採取された対象の種 |
subject_name | VHHが採取された対象の名前 |
subject_sex | VHHが採取された対象の性別 |
サブジェクト
データセットの作成には以下の2頭のアルパカが用いられました。
Name | Species | Sex |
Happy | Alpaca | Male |
Jessica | Alpaca | Female |