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データセット

AVIDa-hTNFa

AVIDa-hTNFa は、ヒトTNFaタンパク質を免疫した2 頭のアルパカから作製した抗原抗体相互作用データセットです。このデータセットには、VHH配列が野生型TNFaタンパク質と結合するかしないかを示すラベルが含まれています。

列の説明

データセットの各列の内容の説明です。

AVIDa-hTNFa.csv

Column
Description
VHH_sequence
VHHのアミノ酸配列
Ag_label
抗原の種類
label
1は結合ペアを表し、0は非結合ペアを表すバイナリラベル
subject_species
VHHが採取された対象の種
subject_name
VHHが採取された対象の名前
subject_sex
VHHが採取された対象の性別

antigen_sequences.csv

Column
Description
Ag_label
抗原の種類
Ag_sequence
抗原のアミノ酸配列

corpus-hTNFa.csv

Column
Description
VHH_sequence
VHHのアミノ酸配列
subject_species
VHHが採取された対象の種
subject_name
VHHが採取された対象の名前
subject_sex
VHHが採取された対象の性別

サブジェクト

データセットの作成には以下の2頭のアルパカが用いられました。

Name
Species
Sex
Happy
Alpaca
Male
Jessica
Alpaca
Female